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mtDNA异质性及其法医学应用

[06-24 00:15:26]   来源:http://www.xxk123.com  热点学习   阅读:8939

导读:控制区碱基变异。实验观察组织问异质性的发生存在与卵细胞形成过程中类似的瓶颈,ciafaloni等发现同一个体不同组织变异型与野生型mtdna出现率有差异,证实了组织问存在异质性的分离。例如某妇女,经过多次提取口腔拭子和血样,检测出异质性,同个体头发材料,5根是16355t,3根是16355c,2根是两种型的混合物。提示在细胞分化、发育过程中也可能存在另一种瓶颈。二、mtdna异质性的类型及好发位置异质性按其存在形式分为点异质性和长度异质性两类,它既可发生在代问也可发生于代内。正常人mtdna异质性高发于控制区,而编码区几乎没有。[61通常,异质性序列之间差异仅限于某一个碱基,称为点异质性。同时出现两个位置碱基序列不同的概率虽小,但仍有报道:而同时出现3个或者3个以上的情况至今尚未见报道。mtdna序列变异主要是复制过程中碱基错配,其中转换占90%以上。少数是颠换。点异质性主要集中于hvi和hvii。hvi碱基转换类型多发生在嘧啶之间,约为80%。hvii的转换碱基中,嘧啶与嘌呤约各占一半。颠换多发生于c和a之间.并几乎都集中在hvi。人群中点异质性的发生率因检测方法

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控制区碱基变异。实验观察组织问异质性的发生存在


卵细胞形成过程中类似的瓶颈,ciafaloni等发现同
一个体不同组织变异型与野生型mtdna出现率有差
异,证实了组织问存在异质性的分离。例如某妇女,经
过多次提取口腔拭子和血样,检测出异质性,同个体
头发材料,5根是16355t,3根是16355c,2根是两种
型的混合物。提示在细胞分化、发育过程中也可能存
在另一种瓶颈。
二、mtdna异质性的类型及好发位置
异质性按其存在形式分为点异质性和长度异质
性两类,它既可发生在代问也可发生于代内。正常人
mtdna异质性高发于控制区,而编码区几乎没有。[61
通常,异质性序列之间差异仅限于某一个碱基,称
为点异质性。同时出现两个位置碱基序列不同的概率
虽小,但仍有报道:而同时出现3个或者3个以上的
情况至今尚未见报道。mtdna序列变异主要是复制过
程中碱基错配,其中转换占90%以上。少数是颠换。点
异质性主要集中于hvi和hvii。hvi碱基转换类型
多发生在嘧啶之间,约为80%。hvii的转换碱基中,
嘧啶与嘌呤约各占一半。颠换多发生于c和a之间.
并几乎都集中在hvi。人群中点异质性的发生率因检
测方法的灵敏度不同而差异很大。hvi 16 189nt碱基
替换的发生率很高,其中t—c转换高达l5%。
长度异质性主要发生于hvi 16184 16193 nt
和hvii 303—315 nt的c—stretch区,表现为c数目
的差异。在序列测定时可观察到16 189 nt和310 nt
后多个信号峰交叠形成的模糊序列,即“手指样结
构”。[71根据anderson序列,c—stretch分别于16 189 nt
和310nt被t阻断,可能由于复制滑动引起的相同碱
基单调连续趋势,该区被认为是突变的热点 而这一
趋势产生了长度异质性。bendall等[8】也认为长度异质
性形成原因主要是dna 复制滑动。无关个体问
mtdna长度异质性差异较大,根据hvii 303 309
nt碱基c数目的多少,可分为单纯同质性(c7)、轻度
异质性(c8为主)、明显异质性(c8和c9为主)和t—c
转换后序列失控(c10一c14)4种。hvi 16 189nt约
l5%的t—c转换中又有66%形成长度异质性。[91与
hvi不同,hvii的t很少缺失。由此认为hvii的长度
异质性机制是c在303—309 nt区域内的插入和复制
滑动,形成3lont p c的转换。同一母系中,与16 189
· l4l ·
突变相关的长度异质性,分布和变化相对稳定,但无
关个体问差异很大。bini等[1ol研究发现异质性长度c
的个数与c—stretch上游的a碱基数目呈负相关,相
对于c数目的不稳定性,同一个体a数目恒定,这一
发现对家系分析和法医学领域中包括单根毛发在内
的组织比较有较大意义。一般而言,如果c—stetch区
的c多于8个,就会增加长度异质性的几率。⋯1
通常.骨骼肌和神经组织的异质性水平相似,毛
发中相对较高.外周血的异质性最低。[121
三、mtdna异质性检测方法
(一)测序
序列测定是检测mtdna多态性和异质性最常用
的方法。尽管一直以来测序被认为是检测突变的金标
准,但若异质性水平低于20%该方法即很难检出,这
也是先前普遍认为异质性发生率很低的原因。克隆后
测序又比pcr产物直接测序更可靠,因其可排除因
pcr过程中taq dna聚合酶滑脱造成的序列改变。
对hvii轻链测序发现,由于临近c—stretch区产生的
长度异质性使3lont的异质性比率达50%,这是一种
普通的人为假象,通过对重链的测序可消除该假象。[131
因此为避免可能存在的影响,mtdna高变区序列测定
要求对重链和轻链进行双向测序,并至少重复一次。
(二)序列特异性寡核苷酸(aso)探针杂交
pcr—aso分析技术先用pcr扩增得到靶dna
片段,再用aso探针与目的dna扩增片段杂交.阳性
结果说明靶dna含有与探针相应的等位基因。尽管
pcr—aso分析技术有操作简单、灵敏度高、特异性好
等优点,但目前所用特异性探针较少,系统的个人识
别能力有限是其局限性之一。多重pcr特异性寡核苷
酸片段用于检测突变链,可以发现小于l%的异质性,
然而等位特异性扩增很容易受pcr初始熔链温度的
影响,易发生错误的扩增,且无法估计异质性的数量。
(三)限制性片段长度多态性(restriction 哪ent
length polymorphism,rflp)分析
在mtdna高变区,大约有2/3的碱基变异涉及限
制酶识别位点,故可用rflp检测点异质性。与直接测

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