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mtDNA异质性及其法医学应用

[06-24 00:15:26]   来源:http://www.xxk123.com  热点学习   阅读:8939

导读:序相比,荧光rflp分析较低程度的异质性更灵敏一些。但应注意避免因不完全消化而导致错误的结论。(四)单链构象多态性(single strand conformationpolymorphism,sscp)分析pcr—sscp技术可灵敏地检测到单一碱基的突变,且具有操作简单、快速、成本低、灵敏度高、无假阳性等特点,适用于大样本dna突变的筛查。但存在影响因素较多、条件不易掌握及带型难以解释等问题。· 142 ·基于毛细管电泳技术发展起来的荧光sscp(f—sscp)技术,其灵敏度非常高,特异性好,但技术要求及成本均很高。(五)变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gelelectrophoresis,dgge)dgge是基于待测dnxx片段双螺旋的解链温度(tm)来进行突变检测的,它具有灵敏度高、分离片段可回收测序、一次可检测大量样本等优势。1999年,steighner等㈣在评估pcr—dgge技术检测mtdnahv1序列多态性的可靠性时。所有设计的49对配对序列(每对仅存在1bp差异)用该技术可全部有效加以区分。pcr—dgge技术检测异质性的

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序相比,荧光rflp分析较低程度的异质性更灵敏一
些。但应注意避免因不完全消化而导致错误的结论。
(四)单链构象多态性(single strand conformation
polymorphism,sscp)分析
pcr—sscp技术可灵敏地检测到单一碱基的突
变,且具有操作简单、快速、成本低、灵敏度高、无假阳
性等特点,适用于大样本dna突变的筛查。但存在影
响因素较多、条件不易掌握及带型难以解释等问题。
· 142 ·
基于毛细管电泳技术发展起来的荧光sscp(f—sscp)
技术,其灵敏度非常高,特异性好,但技术要求及成本
均很高。
(五)变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel
electrophoresis,dgge)
dgge是基于待测dnxx片段双螺旋的解链温度
(tm)来进行突变检测的,它具有灵敏度高、分离片段
可回收测序、一次可检测大量样本等优势。1999年,
steighner等㈣在评估pcr—dgge技术检测mtdna
hv1序列多态性的可靠性时。所有设计的49对配对
序列(每对仅存在1bp差异)用该技术可全部有效加
以区分。pcr—dgge技术检测异质性的灵敏度高达
l% ,远远高于序列测定。但该技术存在实验之初需进
行计算机分析或预试验以确定最佳的分离条件、需使
用带gc—clamp的引物增加了实验费用、gc含量较高
的片段不易分析、制备精确的梯度凝胶需要熟练的操
作技巧及复杂的仪器设备、仅能检测突变的存在不能
确定突变的类型等不足
(六)变性高效液相色谱(denaturing high—performance
liquid chromatography,dhplc)技术
dhplc是一种可自动检测单碱基替代及小片段
核苷酸插入或缺失的一种高性价比分离技术.具有自
动化、快速、经济、检出率高、检出dnxx片段大小范围
广、既可分析已知突变也能筛查未知变异等优点.成
为目前分析已知或未知基因突变及单核苷酸多态性
的最佳技术平台。目前只有f—sscp技术在敏感性和
特异性方面能与dhplc相媲美。其不足是不能检测
纯合突变(要检测纯合变异一定要预混等量的野生型
样品以产生异源杂合双链),只能提示突变的存在.无
法确定具体的错配类型及位置,尚需测序进一步确
定;许多片段有多个主要解链温度.需要筛查的温度
点较多,增加了工作量。
dhplc可直接通过异源双链的形成来检测异质
性的存在。如有必要,还可根据保留时间的差异将不
同的片段各自收集后测序
(七)其他检测方法
融解曲线分析、基质辅助激光吸附电离飞行时间
质谱(matrix assisted laser desorption lonization time
of flight mass spectrometry,maldy—tof—ms).dna
芯片(dna chip)等技术,都可以用于mtdna异质性
的检测
四、mtdna异质性的法医学应用及展望
mtdna因其母系遗传特征、进化速率快、拷贝数
多等特点,使其在法医学鉴定中,尤其是对毛干、指甲
法律与医学杂志20xx年第13卷(第2期)
等无核生物检材或核dna分型失败的样本具有特殊
的应用价值。一方面,由于mtdna异质性的存在,使
其在进行常规个体识别和亲子鉴定等应用时使鉴定
结果产生不确定性;另一方面,mtdna异质性又可作
为个体的特殊标记,增加个体的认定或排除的确定
性。
法医个体识别鉴定中第一次遇到异质性问题是
末代沙皇尼古拉二世的遗骸鉴定案。l15】此后,mtdna
异质性问题逐渐引起法医学界的重视。早期研究认
为.mtdna的异质性在正常人群中很少见,可能与当
时的检测技术缺乏敏感性有关。随着相关技术的发
展.越来越多的文献报道在非编码区检出异质性,并
且以一定的频率存在于正常人群中。2o0o年,tully等
用dgge技术对253个随机个体血样的mtdna
hv1进行了分析.发现35个个体(13.8%)存在异质
性.其中33个为单核苷酸异质.2个为二核苷酸异质,
这些异质性共涉及16个不同的核苷酸.进一步证实
了mtdna异质性存在的普遍性。salas等 (20o1)报
告1例强监案的头发.在同一根被害人头发的2个不
同部位取材.竟然发现序列有差异.一个结果是16 093
t.16 189t:另一个结果是16093c/t.16 189c/t 由于
序列测定检测mtdna异质性灵敏度较低. 因而
mtdna异质性的出现对测序这种在法医学实践中应
用最广泛的mtdna鉴定手段是一种挑战
当比对两份mtdna的序列时.若dna序列相同
则表明这两份检材有可能来自同一个人或同一个母
系亲属,尤其是它们之间还具有相同的异质性时.这

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