第四，要注意校本研究可能出现的问题。一是校本研究的“中心化”，往往会被误导为把国家和地方的决策拒之门外，却又没有在学校内部建立一套完整的决策机制，导致学校发展的无政府状态，这对学校发展是一种伤害。二是学校成员来自四面八方，具有不同的文化背景和生活史，将这些差异巨大的人员组合在一起，如果没有共同决策的经验，没有团队精神，校本研究将令人怀疑或值得商榷。三是校本研究的决策成员或领袖人物，是否具有高度的专业兴趣和必需的知识与能力，是否具有充足的时间，适当的人格魅力和应有的道德准则，对于校本研究的影响非常之大，可能导致研究的成功与否。四是校本研究采取开放式的参与策略，但目前的状况不能表明研究成果与学校改革的进步有必然关系，或者说必然会比其它类型的专业成长途径更有效率。五是教师长期以来处于被压抑状态，普遍缺少批判反思能力和整合能力。如果校本研究缺少激励机制，教师可能产生多一事不如少一事的心态，对一般机构举办的研究不感兴趣，而缺少教师的参与必然导致校本研究的失败。
对校本研究的探究，必须从教学研究的现状出发，从理论和实践两个方面考察校本研究的必要性和紧迫性；立足基础教育的发展，从理论建构和实践策略两个方面，分析校本研究的可行性；回归现实，从学校的具体操作层面，展示校本研究的良性运作案例。基础教育课程改革急切地呼唤以校为本的教学研究的出现。
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